依本會捐助章程第二章規範，本會設董事會，置董事十五至十七人。董事中有適當比例之政府有關機關代表、學者專家及社會人士、及網際網路服務經營者代表。本會亦設監事會，置監事三至五人，其中一人有會計或財務背景或經歷。董事會為最高決策機構，下置執行長一人，承董事長之命辦理各項業務，並有相關輔導執行業務人員。